El Colegio de Dominicos de Santo Tomás de los Ángeles y de Aquino fue fundado por el deán don Carlos de Mendoza en 1529.

Originariamente tenía su emplazamiento en una casa que tenía su mecenas en la calle Empecinado, hoy Convento de las Catalinas, pero posteriormente fue trasladado, en el año 1601, a su actual sede en el número 8 de la calle Colegios, frente a la Hostería del Estudiante. El solar que hoy ocupa fue donado por el cardenal García de Loaysa.

Dependiente de La Magistral, alcanzó gran importancia y llegó a contar, incluso, con imprenta propia. De él salieron, entre otros, ilustres personajes de la época como Melchor Cano y Domingo de Soto.

El edificio, de considerable tamaño, está construido en ladrillo visto sobre zócalo de sillería de piedra caliza.

Destaca la portada lateral, que da a la calle Libreros, y desde la que se accedería a la iglesia. En ésta se puede observar, dentro de la hornacina que remata la puerta, una estatua de Santo Tomás.

La puerta principal, hoy transformada en ventana, se encuentra a la vuelta de la esquina, y cercana a ella existe una sencilla portada que daría paso al colegio en sí.

En el borde de la mencionada ventana, semiocultos, pueden verse dos escudos pintados sobre la pared; uno de la Orden Dominica y el otro de Cisneros.

Tras ser clausurado, el Colegio de Santo Tomás fue destinado a cárcel y hoy se habla de este edificio como futura sede del Parador de Turismo de Alcalá de Henares.